本次修订突出服务生产需求、激励原始创新导向，重点提高品种抗病、机收、产量及DNA指纹差异位点数等方面指标要求，进一步引导提升审定品种质量水平。
一是提高抗病性指标。要求枯萎病病情指数、黄萎病病情指数分别达到高抗和抗等级，有助于应对现阶段棉花连作导致枯萎病、黄萎病加重发生风险。
二是强化机收指标。在生育期、植株形态结构、结铃吐絮性能、脱叶剂敏感度等指标上符合机收要求，引导提高棉花综合机械化水平。
三是提高产量指标。两年区试平均产量指标增产≥3%，同时每年增产幅度不低于1%(提高1个百分点)，生产试验增产点率由≥50%提高至≥60%，明确不同纤维品质类型品种产量指标要求，引导提升棉花单产水平。
四是明确DNA指纹差异位点数指标。要求审定品种与已知品种DNA指纹检测差异位点数≥3个，严防模仿修饰育种和品种同质化。
五是新增耐除草剂转基因品种指标。根据生物育种研发进展增加耐除草剂指标要求，更好适应当前国内生产需要。