2026年北疆棉花种植面积减少幅度低于南疆。其中北疆乌苏地区种植面积减幅高于石河子、昌吉等地；南疆地区库尔勒、尉犁、轮台地区棉花种植面积减少幅度高于喀什、阿克苏等地。整体来看，棉花播种面积减少主要原因也是政策引导对非宜棉区，地下水严重超采区域以及新增荒地棉区和低产低效棉区进行调减，进而推动土地资源向高效益、可持续利用方向转型，实现粮食安全、生态保护与棉花产业发展的协同发展。
5月份新疆多地出现连日降雨天气，且局部地区冰雹、沙尘暴天气偶发，对棉花生长产生不利影响。尤其是气温同比偏低，导致棉花生长偏慢，或造成棉花成熟度不足，单产下滑影响。4月份棉花播种期间，新疆地区天气良好，为棉花出苗提供了有力条件，但5月份生长进展不理想，月底很达到往年“5月现蕾”目标。因此，卓创资讯下调棉花单产预估，预计2026年新疆籽棉单产或同比减少1.56%。
2025年底政策引导新疆棉花种植面积调减，业者预期下降比例或接近10%，但2025年新疆棉花单产及总产量均达到历史高位，棉农收益增长明显，今年种植面积缩减幅度有限。
保障林地绿化率，地下水资源丰富程度，棉农整体收益以及口粮占比等诸多因素，实行一地一策，稳步调控。
5月25日，市场期待已久三年一定的棉花目标价格补贴政策正式落地。国家发展改革委、财政部印发的《关于2026—2028年棉花目标价格政策的通知》表示：按照生产成本加合理收益的原则，综合考虑棉花产业发展需要、市场供需、财政承受能力等因素，2026—2028年新疆棉花目标价格为每吨18600元。如遇棉花市场形势发生重大变化，报请国务院同意后及时调整。统筹考虑近年来新疆棉花生产情况，以及当地水资源、耕地资源状况，对新疆棉花以固定产量510万吨进行补贴。
从政策文件可以看出，未来三年棉花补贴价格与前三年保持18600元/吨不变，同时继续按固定产量510万吨进行补贴。值得关注的是，与往年通知不用之处在于提及：着力保持棉花合理种植规模，优化生产布局，引导非优势区域逐步退出种植，优势区域结合地下水超采情况有序调减。
棉花目标价格政策通知下发后，国内种植户吃下定心丸，市场各方预期国内棉花稳步供应将是大势所趋。同时，根据实际情况，有序调减种植面积也将成为常态。结合近几年棉花种植技术不断提升，棉花单产总体保持增长趋势下，预计国内棉花总产量将趋于平稳。