2017年3月17日，国家发展改革委、财政部发布《关于深化棉花目标价格改革的通知》，棉花目标价格由试点期间的“一年一定”改为“三年一定”。对新疆享受目标价格补贴的棉花数量进行上限管理，超出上限的不予补贴。
2020年3月25日，国家发展改革委、财政部发布《关于完善棉花目标价格政策的通知》，“控制面积、提质增效”的原则引导次宜棉区退出棉花生产、加快全疆统一市场建设、探索新型补贴。
2023年4月10日，国家发展改革委、财政部发布《关于完善棉花目标价格政策实施措施的通知》，对新疆棉花以固定产量510万吨进行补贴，更大范围实施质量补贴。
2026年5月25日，国家发展改革委、财政部发布《2026—2028年棉花目标价格政策的通知》，统筹考虑近年来新疆棉花生产情况，以及当地水资源、耕地资源状况，对新疆棉花以固定产量510万吨进行补贴。
棉花目标价格补贴的实施情况
按照目前内外棉现货价格，抛储底价估计在16091元/吨附近，较上周上涨63元/吨。
工商库存：4月底非保税467.1万吨， 同比-3.68，环比-62.74,新疆库业务棉周度下降9.73万吨。
6月初新疆部分棉区已现蕾，但现蕾率低于去年同期,从全疆苗情长势来看，北疆多数棉区有3-5片真叶，少数已现蕾。南疆多数棉区已现蕾。
据中国棉花信息网调研数据显示，截至2026年6月1日，全疆现蕾率54.1%。环比增加29.3个百分点，同比，慢32.8个百分点。
南疆整体现蕾率67.5%，环比+36.3个百分点，同比慢21.1个百分点。
北疆整体现蕾率34.1%，环比+18.1个百分点，同比慢50.5个百分点。
东疆整体现蕾率81.5%，环比+61.9个百分点，同比慢6.7个百分点。