但从调查来看，近两周全疆大部热量充足，降水量较常年明显少，部分棉区高温与强对流天气交织，导致棉花长势差异比较大。一些灌溉用水充足、土壤墒情比较好的宜棉区，在高频次少滴水（普遍补水6-7次）、加大肥料供应及时防治虫害的条件下，长势普遍达到10台果枝及以上，开花到顶，单产预期较高；但部分棉区因水资源供给不均、灌溉间隔期长（10天及以上，截至7月下旬前补水3-5次）以及管理未跟上等原因导致棉花株高偏矮、果枝多在8台左右，且果枝跳台、空台现象并不在少数。另外，农民对7-8月份持续高温导致落花落铃比例偏高及蕾包头现象的担忧有所加重。
7月中下旬以来，全疆棉花加工企业设备检修及更新、技改等纷纷展开，部分地州、产棉区县已开始举办财务人员培训、消防培训、安监培训等等工作。少数轧花厂判断2026/27年度籽棉收购、加工、经营风险预期偏大，因此采取皮棉盲合“预售”（交货期多在9月下旬至11月中旬前，或按合同数量收购）、与植棉大户及合作社协商代加工（收取加工费、服务费）、与疆内外纺织厂/棉花贸易企业等联合收购（大部分皮棉直接供应纺织厂/贸易商，少量皮棉用于经营）等多种方式规避风险。